口袋妖怪最好玩的版本是：《口袋妖怪守护者2：融合》、《口袋妖怪漆黑的魅影》。
《口袋妖怪守护者2：融合》是由任天堂发行的一款角色扮演类游戏。其玩法与正统不同，会给你不一样的体验。这款游戏的故事发生在阿尔米亚地区，继承了前作《口袋妖怪守护者》的世界观，剧情围绕口袋妖怪世界中一个不同于训练家的职业展开。
游戏中，守护者们利用陀螺来捕获野生口袋妖怪，与它们心意相通，以平息它们的怒火，或借助它们力量清除障碍保护世界，守护者们坚守保护大自然的职责，除了少数自愿跟随的搭档精灵以外，捕获的野生口袋妖怪完成其使命后就会自动放生。
《口袋妖怪漆黑的魅影》系列是任天堂推出的一款Game Boy游戏，有多种Hack版本，《口袋妖怪漆黑的魅影》是成功移植到到PC上的小游戏。
这个版本的最大亮点在于剧情与美工方面，剧情方面的亮点在于创意，极大提高了游戏的可玩性，美工方面效仿国外的改版以及DS的官方版本，替换了大量素材，相较于原版绿宝石有极大进步。
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口袋妖怪最好玩的版本：
口袋妖怪白金；非常不错的NDS，与钻石和珍珠相同，并加入了多种全新的要素。给所有喜欢口袋妖怪系列的玩家带来全新感受。
口袋妖怪黑白2；新作在前作的基础进行了大幅的调整，游戏性能进一步提升，虽是续作却带给玩家足够的新鲜感。
口袋妖怪宝石系列（红，蓝，绿宝石）；所有口袋系列里，最最经典的GBA，本人通关不下十次，是任天堂的招牌游戏。
口袋妖怪白金光；国外口袋妖怪达人基于《口袋妖怪红宝石》所改版的GBA游戏，作为改版，它可以与官方版本所媲美。
口袋妖怪漆黑的魅影；漆黑的魅影是基于口袋妖怪绿宝石制作的同人改版游戏，强大的技术与精良的制作使其成为了国内最优秀的口袋妖怪改版游戏之一。
口袋妖怪xy；口袋妖怪XY是日本任天堂公司在2013年秋季发售的两款3DS游戏，口袋妖怪系列游戏第六世代的第一款正统作品。
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掌机游戏
第一世代（Game Boy）
口袋妖怪红·绿（1996-02-27）
口袋妖怪蓝（1996-10-15）
口袋妖怪红·蓝（1998-09-28）
口袋妖怪黄（1998-09-12）
口袋妖怪卡片GB（1998-12-18）
第二世代（Game Boy Color）
口袋妖怪金·银（1999-11-21）
口袋妖怪方块（2000-09-21）
口袋妖怪水晶（2000-12-14）
第三世代
（Game Boy Advance）
口袋妖怪红宝石·蓝宝石（2002-11-21）
口袋妖怪火红·叶绿（2004-01-29）
口袋妖怪绿宝石（2004-09-16）
口袋妖怪不可思议的迷宫：赤之救助队（2005-11-17）
（任天堂 DS）
口袋妖怪不可思议的迷宫：青之救助队（2005-11-17）
口袋妖怪冲刺赛（2004-12-02）
口袋妖怪益智方块（2005-10-20）
口袋妖怪保育家（2006-03-23）
第四世代（任天堂DS）
口袋妖怪钻石·珍珠（2006-09-28）
口袋妖怪不可思议的迷宫：时之探险队·暗之探险队（2007-09-13）
口袋妖怪保育家：巴特那吉（2008-03-20）
口袋妖怪白金（2008-09-13）
口袋妖怪不可思议的迷宫：空之探险队（2009-04-18）
口袋妖怪心金·魂银（2009-09-12）
口袋妖怪保育家：光的轨迹（2010-03-06）
第五世代
（任天堂DS）
口袋妖怪黑·白（2010-09-18）
对战与收服！口袋妖怪打字练习DS（2011-04-21）
口袋妖怪+信长的野望（2012-03-17）
口袋妖怪黑2·白2（2012-06-13）
（任天堂3DS）
超级口袋妖怪大纷争（2011-08-11）
口袋妖怪不可思议的迷宫：极大之门与无限迷宫（2012-11-23）
第六世代（任天堂3DS）
口袋妖怪X·Y（2013-10-12）
口袋妖怪终极红宝石·始源蓝宝石（2014-11-21）
第一世代（任天堂64）
口袋妖怪竞技场（1998-08-01）
口袋妖怪竞技场2（1999-04-30）
口袋妖怪快照（1999-03-21）
口袋妖怪方块联盟（2000-09-01）
皮卡丘你好吗（1998-12-12）
第二世代（任天堂64）
口袋妖怪竞技场金银（2000-12-14）
第三世代（任天堂GameCube）
口袋妖怪圆形竞技场（2003-11-21）
口袋妖怪整理箱：红宝石·蓝宝石（2003-05-30）
口袋妖怪频道（2003-07-18）
口袋妖怪XD：暗之旋风 黑暗洛奇亚（2005-08-04）
第四世代（Wii）
口袋妖怪对战革命（2006-12-14）
大家的口袋妖怪牧场（2008-03-25）
乱战！口袋妖怪大纷争（2009-06-16）
神奇宝贝乐园Wii 皮卡丘的大冒险（2009-12-05）
第五世代（Wii&Wii U）
口袋妖怪乐园2：超越世界（2011-11-12）
神奇宝贝大纷争U（2013-04-24）
第六世代
神拳（2015）
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