东方三侠和夕阳天使
KOF99
NEST·S，表面上是一个知名的国际企业，实际上却是一个企图征服世界的庞大组织。趁着上界拳皇大会草薙京和大蛇战斗后身体极度虚弱的时机，将其捕获，并利用京的身体进行了一个名为“Project K”的计划，计划内容包括京的克隆、京的战斗数据分析和把”最终决战奥义·无式”分析并将其数据化，还有京的基因移植等。K'和Krizalid就是这计划下的产物。后来，八神庵闯入京身处的研究所大肆破坏，谁知破坏所产生的震动却意外令京苏醒，京也因此而逃离了NEST·S，并行踪不明。
此后不久，NEST·S决定举行新的“拳皇大会”，K'也奉命和马克西马招揽想找寻京的二阶堂红丸和矢吹真吾作为种子选手一同参加该大会。同时，欲找寻自己和京的关系的K’(因为K’不知道自己的火炎力量是从京的DNA移植而来)受意图为好友向NEST·S报复的马克西马唆使而背叛了NEST·S。后来K’他们胜出了大会，并且和NEST·S的干部Krizalid会面。从Krizalid的口中得知，一切都只是为了替复制草薙京军团收集「引子数据」：由于京一生中从没杀过一个人，造成了京的复制人有”无法杀人”的缺陷，因此要收集一些杀人的数据然后将之输入复制人的脑内来填补他们的缺陷。至于收集引子数据的方法，就是和Krizalid战斗后再透过Krizalid的特制衣服传送给布置于世界各地的复制京。在此之后，复制京们便会向各国首都发动袭击，藉此令各国元首投降，轻易征服全世界。可是，本是完美的计划却因为Krizalid的战败而宣告破产， Krizalid更因此而被NEST·S的高层废弃；在临死前更从自己认为是“姊姊”的Whip口中得知自己是K’的复制人，令一直以为K’是自己的复制品的Krizalid大受打击，含恨而终。因为这一次的失败，令NEST·S这个组织的存在曝光.，开始受到军方的关注。
拳皇2000
背叛了NEST·S的K’和马克西马，一直在各地的NEST·S研究所进行破坏，而军方也希望把二人捕获，因此再次举办K.O.F.大会企图引出二人；可是，这一次行动的指挥却不是哈迪兰(Heidern)上校，而是军方的高层”凌”(Ling)司令。另一方面，一直留意著NEST·S的动向的草薙 京得知今届K.O.F.大会并非由NEST·S 举办，大感疑惑。K’和Maxima在军方派出的特务“Vanessa”的刻意安排下再次以种籽选手的身份参加大会，而K’和马克西马的前队友红丸和真吾也联同红丸的旧友兼军方的特务“S”，和中国传说中的暗杀组织「飞贼」的四天王之一---「麟」组成「红丸队」参赛。NEST·S高层Diana和Foxy对于是次K.O.F.大会的动机感到怀疑，同时也察觉有同等权力的Zero有异样的动静；在「K.O.F.大会可能和Zero有关」的推测下， Diana和Foxy派出本是为对抗K’而制作的改造人“Anti K”——Kula Diamond欲妨碍K.O.F.大会。
在K’等人成功在大会中获胜后，当哈迪兰上校向凌司令请示捕获K’时，凌司令却命令部下用枪胁持哈迪兰上校。在基地的显示器上，除了一直被监视的K’等人外，更出现了一个样貌和凌司令一模一样的人。这个自称Zero的男子，在暗杀了真正的凌司令后再把自己的复制人配置在军方，以凌司令的身份掌握军方的指挥权。Zero此举的目的是想收集格斗家的力量转化为启动卫星兵器“Zero Cannon”的能量，再把Zero Cannon向NEST·S的总部发射，意图消灭NEST·S再统治全世界。凭著特殊战斗服的性能，Zero曾一度令K’等人陷入苦战；可是，Zero却因为低估了K’的潜能而落得惨败的下场。虽然在战斗中落败，但启动Zero Cannon所需的能量却已足够；在Zero以必胜之心按下起动钮时， Zero Cannon却无法运作。原来，Zero Cannon在Zero和K’等人决斗时已经被Diana和Foxy派遣的Kula所占据；Kula把Zero Cannon的目标改为Zero身处的基地；Zero也在绝望之中被自己的皇牌吞噬。
Whip在Zero的口中得知了自己和K’的姐姐异常的相像，而后来在同一地点调查Zero死因的京也被一直找寻自己的庵发现，可是京机敏地成功逃脱，暂时免了一场麻烦。而麟在Zero Cannon发射后被瓦砾压住大腿受伤，却在此时重遇早已失踪，现已投靠NEST·S的飞贼之长--“龙”，龙更向麟道出了自己灭绝飞贼一族的事实。在危急关头，红丸出手击退了正想对麟下杀手的龙。
游戏类型 FTP格斗游戏
游戏年龄 12岁以上
发售日期 2001年
游戏人数 1-2人
发售厂商 SNK
拳皇2001
这一版本是“NEST·S篇”三部曲的完结篇。与之前的援护攻击系统相比，可以更加自由的对战（采用了4对4的战略组合援护系统，可以组成在至今为止的“拳皇”系列中从未出现过的援护组合模式）。此外，在连续技系统中加入了“Wire Damage”，实现了新的攻击进化。
得到Whip加入的K’和Maxima一如以往，不断破坏NEST·S的研究所和据点；可是，事情好像在NEST·S的意料之内一般，K’他们所到之处都已空无一人，或是已经废弃。此时， NEST·S却高姿态地以贸易机构的名义举办新的K.O.F.大会。K’等人在感到万分疑惑之下，联同在一次行动中抓到的，为了向龙报灭族之仇的麟一起参加大会，而一直隐藏著行踪的京也和好友红丸，久休复出的大门五郎和自称是京入室弟子的真吾一起参加大会；庵则是被军方视作监视的对象，在军方的特务Vanessa和S劝诱下，也参加了大会。最后，在庵无视大会规则攻击不是比赛对手的京而令京无法准时出席比赛的情况下，大会仓猝宣布K’等人成为冠军。在K’等人乘上飞船前往NEST·S位于宇宙的总部时，真正的Zero(在之前叛变的是复制人一号Zero-1)出现欲“考验”K’，但也被K’打败。在同一时间的地面上， NEST·S的高级干部，以NEST·S的名义参加大会的Foxy被同队的K9999所杀。最后，K’等人到达了NEST·S的总部后，幕后主脑Igniz出现，并告诉K’等人这一切都是为了使自己成为“神”所下的棋。Igniz说，他必须作为人类中的最强者“拳皇”，才能让世人认同他这个“神”的存在。众人为了粉碎他的疯狂野心，决心与他决一死战。
关于两个复制人
是因为三神器（草薙，八神，神乐）与大蛇大战之后，所受了伤，三人各自从大蛇空间飞了出去
，其中草薙京飞的最远，十分虚弱，NESTS就趁机把草薙京抓走了，他们使用草薙京的DNA复制出了KYO-1 KYO-2 K' K9999 NAMELESS（详见02um）和99的BOSS
顺便一提，NESTS还把草薙京的“无式” 装入了ZERO大炮中（详见2000）...
12486