口袋妖怪叶绿通关后
等着它过去之后，就回到主人公原来的村子了，回到大木博士研究所，和他对话，博士将我带到研究所里将妖怪图鋻升级为386图鋻（需要妖怪捕获数在60只以上）之后来到枯叶市(卡吉市）的码头，坐船回到一号小岛，和PC屋右边的那个博士谈话之后他把船票和地图升级，然后往北走，来到捉火鸟的山脚下，上了台级往右走，在尽头发现两个火箭队的成员守在一个山洞口，和他们对战后，进入山洞，在最深处找到了一块红寳石，出了山洞，回到一号岛屿的PC屋里，将刚才在山洞得到的红寳石交给右边的博士，出了PC屋，来到码头，现在以经可以坐船去四号小岛。
来到四号小岛，（冰天王康娜的老家），发现了一个妖怪饲养屋，现在才可以让妖怪生蛋，另外还在一个居民家里得到进入训练员塔的通行证，从四号岛屿上右边的小水塘里游过去，来到了一个冰冻的瀑布里，进入瀑布左边的洞里，在里面找到07号特技攀登，攀上那条瀑布了，在山洞里面遇到了冰天王，她正在训斥一群火箭队员，我见到这个欺负火箭队员的好机会当然不会放过了，和冰天王一起轻松搞定了他们，在冰天王的威胁下得到了开门的密码（またまた
ダマダマ，以后会用到），之后来到码头，坐船到五号岛，岛右下有火箭队的基地，使用密码后……门还没有开，原来还少另外一段，只好坐船到了六号小岛和岛上的人谈话后，来到小岛最南部的大门前，用砍树特技将大门打开，在最深处找到一块蓝寳石，但没有密码拿不走这时候火箭队的一个研究员突然到来，抢走蓝寳石，顺便得到了另外一段密码（カブトはとぶか，汗……甚麽么样的密码啊），追到五号小岛上的火箭队基地里（基地里有特殊的球，隐藏的），来到五号小岛上右边的火箭队研究所里，拿回蓝石，来到一号岛屿的PC屋里，将找到的蓝寳石交给博士，最后可以到七号小岛！小岛路上山洞里的石头分别推入凹坑里，神秘PM安侬就会出现在下面的遗迹里
最后就可以回到花田市，在花田市的左边山洞拦住出口的人现在已经离开，终于可以进入山洞捕捉最强的口袋妖怪超梦了（非常好用...
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